বর্তমান সরকার ক্ষমতায় আসার পর জঙ্গি কার্যক্রম এমনিতেই অনেকটা গুটিয়ে যায়। এরপর আইন-শৃঙ্খলা বাহিনীর অব্যাহত অভিযানের মুখে দাঁড়াতেই পারেনি জঙ্গি সংগঠনগুলো। কিন্তু সরকারের শেষ সময়ে রাজনৈতিক অস্থিরতার সুযোগ নিয়ে আবারও মাথা তোলার চেষ্টা করছে জঙ্গি সংগঠনগুলো। বাংলাদেশে জঙ্গি কার্যক্রমের শুরু থেকে এখন পর্যন্ত যত ব্যক্তি ধরা পড়েছে তাদের সবাই একই নেটওয়ার্কে জঙ্গি কার্যক্রমে সম্পৃক্ত হয়েছে। ১৯৯২ সালে আফগান ফেরত মুজাহিদদের মাধ্যমেই বাংলাদেশে জঙ্গি কার্যক্রম শুরু হয়। সেই সময় তারা হরকাতুল জিহাদ বাংলাদেশ (হুজি) নামে একটি সংগঠনের ব্যানারে মাঠে নামে। এরপর থেকে শতাধিক জঙ্গি সংগঠন হলেও সবই কিন্তু হুজির আদর্শ নিয়ে মাঠে নামে। অনেক সময় এক সংগঠন ভেঙে ভিন্ন ভিন্ন সংগঠন তৈরি হয়। সব সংগঠনেরই নেতৃত্বে আফগান ফেরত মুজাহিদদের কেউ না কেউ ছিল। বর্তমানে আলোচিত জঙ্গি সংগঠন আনসারুল্লাহ বাংলা টিমেরও আধ্যাত্মিক নেতা শায়খ আবদুর রহমান (ফাঁসি কার্যকর হয়েছে)। বাংলাদেশে যেসব জঙ্গি কাজ করে তাদের মধ্যে একটা চেইন আছে। বিচ্ছিন্নভাবে নতুন কোন আদর্শ নিয়ে কেউ মাঠে নামেনি। সবার একটাই আদর্শ 'সশস্ত্র বিপ্লবের' মাধ্যমে ইসলামী রাষ্ট্র কায়েম করা। এখন যারা দায়িত্বে আছেন তারা পূর্বসূরীদের অসম্পন্ন কাজ শেষ করতে চান। আবার উত্তরসূরীদের জন্য তারা নতুন কিছু কাজ রেখে যেতে চান, যা তারা পালন করবে। জঙ্গিরা যাদের 'কোতল' করতে চায় তাদের নাম ও পরিচয় দিয়ে একটি ডাটাবেজ তৈরির উদ্যোগ নিয়েছিল। ডাটাবেজে যাদের নাম থাকবে এর মধ্যে তারা যে ক'জনকে পারবে শেষ করে দেবে। আর যারা বাকি থাকবে তাদের শেষ করবে উত্তরসূরীরা। একটা সার্কেলের মতো কাজ করে জঙ্গিরা। বিভিন্ন সময়ের সরকার তাদের ব্যবহার করে পরে ছুঁড়ে ফেলে দিয়েছে। তাই কারো পক্ষে কাজ করার আগে চিন্তা করারও পরামর্শ পাওয়া যায় ওই নথি থেকে। বর্তমান সরকারের সময় তাদের কার্যক্রম চালানো কঠিন হয়ে পড়েছে বলে মনে করে তারা। তাই যে কোনভাবে এই সরকারকে ফেলে দেয়ার চিন্তাও ছিল তাদের। হুজি ভেঙেই গঠিত হয়েছিল জামা'আতুল মুজাহিদীন বাংলাদেশসহ কয়েকটি সংগঠন।আর এভাবেই তারা তাদের কার্যক্রম চালানোর চেষ্টা করে যাচ্ছে।